江梦瑶把这句话写进程序注释，又删掉。地址发布邮箱 LīxSBǎ@ＧＭＡＩＬ．ｃＯＭ
注释太多，会影响代码结构。
她重新建立了观测状态和隐状态之间的映射关系，将传统的离散转移矩阵拆成多个局部拓扑单元。
每个单元只负责一段序列。
不同单元之间，通过分形边界进行连接。
这样一来，原本需要整体计算的庞大矩阵，被拆成了数万个可以独立运行的小矩阵。
维度灾难的根源，来自所有数据必须同时参与计算。
她要做的，就是让数据分开。
工作站屏幕上，代码一行行向下滚动。
江梦瑶左手托着下巴，右手敲击键盘，速度始终没有变化。
她在脑海里同步推算着矩阵变化。
传统维特比算法需要不断回溯所有路径，寻找概率最高的那一条。
这个过程会消耗大量算力。
江梦瑶直接砍掉了回溯步骤。
每一段序列只保留局部最优路径，再通过分形边界进行二次修正。
这样做的风险很高。
一旦边界函数出现误差，前面的判断就会全部偏移。
江梦瑶盯着屏幕上的公式，指尖在桌面上轻点两下。
风险可以接受。
她要的是新算法，不是给旧算法换一层外壳。
键盘声持续了整整三个小时。
她调出一组公开基因数据库，先用一千条样本进行测试。
程序刚运行十秒，窗口突然弹出一片红色警告。
内存占用超过百分之九十。
江梦瑶停下敲键盘，目光落在报错位置。
问题出在边界函数。
分形维数设定为一点七五时，局部矩阵会发生重复展开。
她把参数改成一点六二，又重新运行。
这一次，内存占用降到了百分之四十。
准确率却从百分之七十四跌到了百分之四十一，模型直接失去了意义。
江梦瑶皱起眉头，开始寻找问题到底出现在哪里。
她不断的移动光标足足花了小半个小时，这才发现问题所在。
她随手拿起笔，在A4纸上写下两组参数。
一个负责压缩，一个负责校正。
单独使用都不够稳定。
那就让它们交替工作。
她重新敲入一段控制代码，让分形维数根据样本长度动态变化。
序列越长，分形维数越低。
序列越短，分形维数越高。
局部数据不足时，增加路径保留数量。
数据足够时，直接关闭多余分支。
程序再次启动。
这回，红色警告消失了。
屏幕下方的进度条开始移动。
百分之十。
百分之三十。
百分之六十。
江梦瑶端起旁边的冷水喝了一口，继续盯着数据变化。
另一边，生科院教研室。
陈建国把手里的实验记录本合上，目光落在吴建华身上。
“她已经进去四天了。”
吴建华夹着烟，烟灰落在桌边。
“你敲过门没有？”
“敲了两次，里面没动静。”
陈建国抬手摸了摸额头，
“一个月写出三区论文，选题、建模、跑数据、整理结果，哪一步都要时间。
她现在连人都不出来，拿什么完成？”
吴建华把烟掐灭。
“老罗呢？”
“查资料去了。地址发布邮箱 LīxSBǎ@ＧＭＡＩＬ．ｃＯＭ”
“他怎么还有心情查资料？”
陈建国把桌上的内网打印件推过去：
“我看他是准备找江梦瑶的漏洞。”
话音刚落，办公室门被推开。
罗成文抱着一摞外文论文走了进来，手里还拎着那只保温杯。
他的脸色不太好，走到桌边，直接把其中一篇论文摔在桌上。
“简直是胡闹！”
吴建华抬起眼皮。
“你又发什么疯？”
罗成文抽出一页数据，指着上面的曲线。
“隐马尔可夫模型，国际上最成熟的算法之一。
维特比路径经过十年优化，全球实验室都在用。”
“国内最高准确率是多少？”
“百分之六十八。”
罗成文把另一张纸压在上面。
“国际顶尖团队借超算跑了半年，公开结果也只到百分之七十。
她一个大一学生，拿一台普通工作站，准备在一个月内推翻底层算法？”
他的手指敲在桌面上，纸张跟着跳了一下。
“这叫研究？这叫拿前途赌气！”
陈建国拿起那份打印件，逐行扫过。
“她选的是基因序列剪切位点预测。”
“我看到了。”
罗成文抓起保温杯，杯底重重碰在桌上。
“生物信息学的坑，比你们实验室的废弃路线还多。
样本偏差、噪声干扰、过拟合，每一个都能让她的结果变成废纸。”
吴建华没接话。
他翻到打印件最后一页，那里列着江梦瑶下载过的文献名称。
全是隐马尔可夫模型。
陈建国合上纸张，声音沉了些。
“要不我们直接过去，把门敲开。”
“我去。”
吴建华站起来，抓起外套。
“她再这么熬下去，论文没写出来，身体先垮了。”
罗成文伸手拦住他。
“你们谁也别去。”
吴建华看向他。
“你刚才还骂她胡闹。”
“我骂归我骂，门不能敲。”
罗成文把打印件翻到中间一页，指尖压住一行公式。
“你们看这里。”
陈建国凑近。
“这是她下载的另一篇文献，讲的是分形几何在序列分析中的应用。”
“这有什么？”
罗成文没有回答，抓起桌上的黑色水性笔，在空白处写了一个公式。
“她准备把基因序列映射到分形流形上。”
吴建华盯着那行公式，烟盒从掌心滑到桌面。
“这能避开维特比算法的路径冗余？？？”
“理论上是有这个可能的”
罗成文的笔尖停在半空。
“传统模型把每个碱基当作独立节点，节点越多，路径数量越夸张。
这些节点和路径会消耗大量的数据和算力，而且路径越多，出错的可能性就越多。
她要把这些节点放进连续流形，用局部边界代替全局回溯。”
陈建国喉结动了一下。
“等于把一张乱网，拆成许多小区域？”
“还要让小区域彼此共享边界条件。”
罗成文盯着那行公式，声音慢了下来。
“如果边界函数构造正确，维度灾难确实能被压下去。”
吴建华把烟盒推到一旁。
“你刚才还说她在拿前途赌气。”
“现在依旧有风险。”
“那你还拦着我们？”
罗成文收起笔，拿起外套。
“我去帮她。”
陈建国抬头。
罗成文已经走到门口，又回头补了一句。
“把我那台备用显示器搬过去，再拿一条网线。
她的工作站接口太少。”
吴建华盯着他的背影。
“你不反对了？”
罗成文把外套脱下来，搭在椅背上。
“我反对她一个人做。”
“那你留下来。”
“我留下来给她改代码。”
罗成文说得干脆，甚至把袖口往上卷了两圈。
“她的程序如果能跑通，这篇论文就别投三区。”
陈建国的手停在纸面上。
“你的意思是？”
罗成文推了推眼镜。
“二区。”
他抱起显示器，转身朝门外走。
“有机会，就冲二区。”
十分钟后，单身公寓门口。
罗成文把显示器放在地上，抬手敲门。
“江梦瑶，开门。”
里面没有回应。
他又敲了两下。
“我带了设备，也带了代码。
你把接口给我，我替你处理矩阵调用。”
门内传来键盘声，连续不断。
罗成文等了几秒，继续开口。
“你一个人跑程序太慢，论文也需要有人整理。”
门开了一条缝。
江梦瑶站在门后。
她先看了眼显示器，又看向罗成文。
“这可是计算机代码，老师不是研究数学的吗？”
罗成文没好气的翻了个白眼。
“数学是一切的基础，就计算机那些代码，还能难倒我？”
江梦瑶侧身让出位置。
罗成文抱着设备进门，把显示器接上工作站。
屏幕分成两块。
左侧是源代码，右侧是实时运算窗口。
罗成文坐到桌边，活动了一下手指，准备接过键盘。
江梦瑶把键盘抽走。
罗成文的手停在半空。
“你这是什么意思？”
“老师在肯定会影响我的思路。”
罗成文看着她，脸上顿时露出不满的神色。
作为清华大学数学系的教授，他还第1次被学生给嫌弃。
不过，想到刚才出现在脑海中的可能性，他并没有离开：
“我可以口述。”
“口述也会打断我的计算。”
江梦瑶指向门外。
“你把显示器留下，人出去。”
罗成文抱着外套站在桌边，想争一句，视线却落到了右侧的运行窗口。
程序已经完成百分之八十三。
内存占用百分之四十六。
他所有准备好的话都被压了回去。
这才运行了不到一分钟。
罗成文拿起外套，退到门口。
“至少把结果发给我。”
江梦瑶重新敲下回车。
“等我确定模型没有问题，我自然会发给老师看看。”
门在他面前合上。
楼下，吴建华和陈建国正抬头等着。
陈建国先迎上来。
“怎么样？”
罗成文把外套搭在臂弯里。
“她觉得我会影响她的思路。”
吴建华愣了两秒，转头看向陈建国。
“老罗也有今天。”
罗成文没有理会，指了指楼上。
“她的模型已经开始运行，先别去打扰。”
陈建国立刻收起笑意。
“能跑？”
“运行上没有问题，准确率有多少就不好说了。”
罗成文伸出手，接过吴建华递来的烟，却没有点燃。
“只要结果没有问题，就算投不了2区，3区也大概率没问题。
毕竟这可是重新开拓了一个新的思路！”
消息传回教研室后，几位教授先后赶到家属区。
他们没有上楼，只守在单元门附近。
每个人手里都拿着不同资料，谁也不再提敲门。
第五天，李长明来到楼下。
他扫了眼守在花坛旁的四个人，手指在文件夹上轻敲。
“怎么都在这里？”
吴建华把身体往前挪了半步，挡住通往楼道的路。
“散步。”
李长明看了看他手里的实验数据，又看向罗成文。
“罗教授也有这个习惯？”
罗成文端着保温杯，目光落在别处。
“最近空气好。”
李长明抬头看向三楼窗口。
窗帘拉得严实，里面没有任何动静。
他压住嘴角的笑意。
“江同学还在闭关？”
“她在做论文。”
“进度怎么样？”
李长明把文件夹夹在腋下，语气听着关切。
“我也不要求她真能发三区，能交一份完整初稿，学校可以酌情处理。”
吴建华的手指在袖口里收紧。
这句话听着留情，实际已经把退路摆了出来。
论文交不上，特权就得收回。
“不需要！江梦瑶自己能行的！”
十五天过去，公寓里依旧没有人出来。
在他看来，这个结果已经足够说明问题。
天赋可以让人学得快。
论文需要数据、实验、验证和同行审查。
江梦瑶的天赋确实很强，但她跑得太快了，最后总要摔下来。
楼上，江梦瑶敲下最后一行代码。
程序开始运行。
数据量三万八千六百条。
传统模型预计耗时十五天。
新模型的进度条向前移动，内存占用保持在百分之五十以内。
整体消耗的算力，甚至比预期的还要低。
这种算力，随便一个实验室都能够满足。
10%·······
33%·······
99%·······
江梦瑶靠在椅背上，指尖从键盘上收回。
屏幕右下角，运行时间跳到二十七分钟。
进度条抵达100%。
一行黑色结果出现在窗口中央。
“准确度: 91.84%。”
看到这个结果，江梦瑶彻底松了口气。
经过半个月的奋斗，总算是拿到了想要的数据。
按照罗教授的说法，目前国际上最先进的70%。
而她推倒重来，重新构建的这个模型，直接把准确率提高到91%！
虽然这个模型并不是通用模型，目前只能用于实现基因序列剪切位点预测。
但是想要通过这个模型，来发一篇顶区的论文，绰绰有余了。
而且依靠这个思路，想要继续扩展，用于分析其他的生物需求，甚至是摸索出一个通用模型，也不是不可能的事情。
门外，罗成文刚抬起手刚敲房门，就在他以为江梦瑶又要等好一会才会开门的时候。
屋内传出江梦瑶清晰的声音。
“罗老师，二区期刊的名单，准备好了吗？”